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Linking the resistome and plasmidome to the microbiome

Hi-C将耐药基因组和质粒基因组与宿主微生物基因组关联

期刊:The ISME JournalIF10.3

时间:2019.5.30

主要内容primary coverage

研究者构建了两类废水样本,1份不做处理命名为WW1份添加了E. coli,该菌株含有多重耐药质粒命名为WWEC。两份样本分别进行宏基因组和Hi-C分析,Hi-C数据分别将2份样本的宏基因组组装的contigs聚类得到1000个以上clusters,其中分别有51WW)和38WWEC)个clusters的组装完整性高于80%Hi-C数据能够重现多重耐药质粒与其宿主间的关系。


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