Linking the resistome and plasmidome to the microbiome
Hi-C将耐药基因组和质粒基因组与宿主微生物基因组关联
期刊:The ISME Journal(IF:10.3)
时间:2019.5.30
主要内容primary coverage
研究者构建了两类废水样本,1份不做处理命名为WW,1份添加了E. coli,该菌株含有多重耐药质粒命名为WWEC。两份样本分别进行宏基因组和Hi-C分析,Hi-C数据分别将2份样本的宏基因组组装的contigs聚类得到1000个以上clusters,其中分别有51(WW)和38(WWEC)个clusters的组装完整性高于80%,Hi-C数据能够重现多重耐药质粒与其宿主间的关系。